銅(II)イオンはβジケトンや炭酸イオン、Schiff塩基、エチレンジアミン、bispyridine、フェナントロリンなどの酸素あるいは窒素をドナー原子とするリガンドと安定な錯体を形成します。ポリアザマクロ環リガンドは銅(II)イオンと結合し、熱力学的・動力学的に極めて安定で不活性な錯体を形成します。
銅は様々な化合物を形成し、多くは有色です。銅の主な酸化度は、+1および+2ですが、+3の錯体も知られています。銅(I)化合物は反磁性であり、電荷移動やアニオンの影響がない限り一般に無色とされます。+1イオンは四面体あるいは平面四角形の幾何学配置を取ります。固形化合物では、銅(I)イオンは中温でより安定です。銅(II)イオンは水溶液中でより安定です。銅(II)イオンの化合物は第二銅化合物と呼ばれ、有色です。これらの化合物は広範囲の立体化学配置を取りますが、4、5、6配位化合物が主です。しかしながら、Jahn Teller効果により規則的な配置はまれであり、歪んだ八面体配位が一般的です。4配位の平面四角形錯体はアンモニア、ピリジン、および窒素ドナーリガンドを有するキレート剤(エチレンジアミン、bispyridine、フェナントロリンなど)を含む他のアミンなどにより容易に形成されます。塩基性の溶液中では、ビウレットは銅(II)イオンと反応して青紫色を呈する錯体を形成します。これがビウレットプローブであり、蛋白質やペプチドの検出に用いられます。銅(II)イオンはβジケトン、カルボンイオン、Schiff塩基などの酸素ドナーリガンドとも安定な錯体を形成します。銅-64(β線源および陽電子線源)と銅-67(β線源)は核医学においてイメージングと治療に用いられる有用な放射性同位体です。ポリアザマクロ環リガンドは銅(II)イオンと結合し、熱力学的・動力学的に極めて安定で不活性な錯体を形成します。銅(II)イオンに対する双機能性リガンドは複数合成されています。TETA由来のp-bromoacetamidobenzyl TETAやDOTA由来のp-isothiocyanatobenzyl DOTAはそれらに含まれます。
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